基金留底仓和清仓的区别在于卖出后仓中所剩基金的份额不同。留底仓是指卖出部分仓中的基金，还留下一部分基金的份额，而清仓则是卖出仓中所有的基金，直接换仓。留仓意味着更多的选择，在未来的行情中处于可进可退的位置，但是如果仓中基金的趋势已经走坏，未来必跌时，果断清仓是更好的选择。
留底仓的好处
一、好处
1、底仓一般是中长线股民的选择，底仓不动，然后做高抛低吸，降低成本，获取最大利润。有底仓也是一种防止踏空的操作手法。
2、记录盈亏，便于总结经验，
3、防止卖出再涨，如留有底仓，可以减少错过上涨失去的收益。
4、可以短期做T，因为有底仓，可以今天买，明天卖。
5、有效减少回调带来的心理压力。
6、有效回避满仓带来的风险。
二、意义
1、清仓和留底仓是策略和方针上的问题。
2、作为短线投资者，他们更多关注的是股票短期的一个走势，通过一个相对低点（一个波浪底部）买进，一个相对高点（一个波浪顶部）卖出，做一个差价获利，当短期还有可能冲高的情况下，投资者可能卖出一部分以获利，保留一定仓位，如果股票继续冲高到一定位置再出售剩余股票，就可获利更多，而假如从谷峰又跌回一个相对低位，投资者可用卖出的那部分资金再抄底，此时就有比原来更多的资金买进了这只股票（股份增加），等涨到一定高位卖出以获利。
3、作为长线投资者，他们更多的是关注政府政策导向，大盘的后期的一个长期走势，以及股票的基本面即上市公司的盈利预期等等，他们看好某只股票后，选择一个低位买进，然后长期持有，之间可能有很多次的起伏，但是几乎都不操作（因为普通股民很难预测短期走势，不操作有可能比操作更有利），而是把握一个大方向，等股票通过一个长时间的震荡，涨到一个适当位置卖出以获利。
