根据基金会管理条例，基金会的设立由民政部门审核，具体的申请机构是地方性的民政部门还是国务院民政部门与设立的慈善基金会的性质，规模等方面相关。像全国性公募基金会，原始基金超过2000万元的非公募基金会，法人代表为非内地居民的基金会等等情况，需要向国务院民政部门递交申请。
设立一家非公募基金会，根据《基金会管理条例》，需要双重管理：
不仅需要到民政部进行登记（实为审批），还需要挂靠一家慈善领域相关的“业务主管单位”（一般为机关和党政部门，业界称之为“婆婆”）。
由于找不到可以挂靠的业务主管单位，一些民间慈善组织无奈采取公司的形式，以营利组织的形式从事慈善活动，但在财务和税务上成本很高。
设立基金会，应当具备下列条件：
（一）为特定的公益目的而设立；
（二）全国性公募基金会的原始基金不低于800万元人民币，地方性公募基金会的原始基金不低于400万元人民币，非公募基金会的原始基金不低于200万元人民币；原始基金必须为到账货币资金；
（三）有规范的名称、章程、组织机构以及与其开展活动相适应的专职工作人员；
（四）有固定的住所；
（五）能够独立承担民事责任。
建立一家基金会需要遵循以下步骤：
1、决定基金会的宗旨。每个基金会应该有一个表述存在原因的落在纸面的宗旨。
2、组建理事会。初始的理事会将通过规划和筹资帮助工作团队把基金会背后的想法变成现实。随着基金会的发展成熟，理事会的性质和组成人员也会改变。
3、起草章程。章程是理事会的运营规则，应该在基金会的早期发展过程中由理事会通过。
4、准备注册需要的原始基金，原始基金必须为到账货币资金。
5、选择一个业务主管部门，获得业务主管单位同意设立的文件。根据最新的政策，一些地区不需要再找业务主管单位。
6、寻找办公场所，招募合适的工作人员。
7、填写法人登记申请书，确定在哪个民政部门登记，向民政部门提交法人登记申请书。国务院民政部门和省、自治区、直辖市人民政府民政部门是基金会的登记管理机关。
8、进行战略规划。战略规划表述了基金会潜力的愿景。战略规划应该描述出实现这个潜力所必需经过的步骤，决定要实现这个机会需要什么样的工作团队，确定至少一年内的项目和运作优先事项。
9、制定预算计划和资源开发计划。财务监管和资源开发（如筹资、获得收入、吸收会员会费）是理事会的最重要职责。实现战略规划需要的资源必须在预算和财务计划中描述清楚。
10、建立基金会正式文件的存档体系。登记文件、理事会会议记录、财务报告和其他正式文件都应该妥善存档。
11、建立会计体系。基金会财务的尽职管理需要一套已经确立的可以满足现状和未来需求的会计体系。
12、提交税收减免资格申请。
