证券和基金的区别主要在于风险程度的不同、收益情况的不同、投资方式的不同以及组成形式与获取利益方式的不同。一般意义上而言，证券投资所需要的专业知识与技能水平是高于基金投资的。
狭义的基金一般意义上是指公募基金、私募基金公司等发行的基金品种，从广义角度来讲，还涉及创投公司PE基金、证券公司直投基金、上市公司并购基金、私募基金公司股权基金、代表政府职能出资的产业基金、创业投资基金等等； 分为契约型、公司型、有限合伙型等主要类型；狭义的证券一般是指股票，广义的说，包括基金、期货、期权、债券、各类衍生品、利率、外汇工具等。
首先，证券与基金的风险程度不同。一般情况下，证券的风险大于基金。
其次，证券与基金的收益情况不同。一般情况下，由于证券普遍拥有更高的风险，因此潜在收益也比基金更高；而同为基金，由于投资的标的不同，其风险大小与收益高低也会有所不同，例如指数跟随性基金的风险就低于股票型基金的风险，与此同时预期收益也低于股票型基金。
第三，证券与基金的投资方式不同。证券投资者绝大部分时间内均是由投资者自身完成买卖操作，而证券投资基金是一种间接的证券投资方式，基金的投资者不再直接参与有价证券的买卖活动，不再直接承担投资风险，而是由专家具体负责投资方向的确定、投资对象的选择。
最后，基金、股票、债券都是有价证券，对它们的投资均为证券投资。基金份额的划分类似于股票:股票是按"股"划分，计算其总资产;基金资产则划分为若干个"基金单位"，投资者按持有基金单位的份额分享基金的增值收益。契约型封闭基金与债券情况相似，在契约期满后一次收回投资。另外，股票、债券是证券投资基金的投资对象，在国外有专门以股票、债券为投资对象的股票基金和债券基金。
