购买商业健康保险可以抵扣个税的操作流程是：
1、购买符合扣除条件的商业保险，保险公司开具相应的发票和保单凭证，并在保单凭证上注明税优识别码。
2、向公司财务部提供税优识别码和相应的材料，财务人员向地税部门提出申请，在计算个税时扣除相应的保险费用。
根据财政部、税务总局、保监会联合制发的《关于将商业健康保险个人所得税试点政策推广到全国范围实施的通知》(财税〔2018〕39号)规定，自2018年7月1日起，将商业健康保险个人所得税试点政策推广到全国范围实施。
对个人购买符合规定的商业健康保险产品的支出，允许在当年(月)计算应纳税所得额时予以税前扣除，扣除限额为2400元/年(200元/月)。单位统一为员工购买符合规定的商业健康保险产品的支出，应分别计入员工个人工资薪金，视同个人购买，按上述限额予以扣除。
这项政策主要适用于以下五类人群:
一、工薪阶层，如单位的员工、有相应固定单位的人;
二、给一些单位做咨询或者设计上的服务要求连续三个月以上的;
三、个体工商户业主为自己购买，为员工、雇工购买也是适用人群;
四、企事业单位承包、承租的业主;
五、个人独资、合伙企业投资者为自己购买的。
个人购买商业健康保险但未获得税优识别码，以及购买其他保险产品的，不能享受税前扣除政策。因此，纳税人要辨别一款保险产品是否可以享受个人所得税扣除政策，主要看购买时能否取得税优识别码。
个人购买符合规定的商业健康保险产品，保险期满后未续保或退保的，应于未续保或退保当月告知扣缴义务人终止税前扣除。
